如果您是使用 MP3 編碼，便可以自訂設定，以進一步控制所匯入檔案的品質或大小。
若要自訂 MP3 編碼的設定：
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選擇 [編輯] > [喜好設定...]，按 [一般] 一下，然後按 [匯入設定] 一下。
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從 [匯入使用]快顯功能表中選擇 [MP3 編碼器]。
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請從 [設定]快顯功能表中選擇 [自訂...]。
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在出現的對話方塊內，選擇設定：
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立體聲位元傳輸率：[單聲道] 或 [立體聲] 的每秒千位元 (Kbps) 愈高，音訊品質愈好，且檔案愈大。最常用於立體聲 MP3 檔案的位元傳輸率是介於 128 Kbps 到 192 Kbps 之間。與音樂不同的是，包含錄音項目的聲音檔案適合使用較低的位元傳輸率。
可變式位元傳輸率編碼 (VBR)：此設定會根據音樂的複雜性來決定用來儲存音樂的位元數。如此可以幫助將檔案大小維持到最小。
取樣頻率：即以數位方式捕捉音樂波型的每秒鐘次數。取樣頻率愈高，音訊品質愈好，且檔案愈大。請勿選取較之前儲存音樂所使用之頻率高的取樣頻率，否則將會浪費空間。舉例來說，若光碟品質為 44.100 kHz，則不需要在從光碟上編碼時選取較高的編碼率。一般來說，與原音樂使用相同編碼率的 [自動] 模式是最佳的選擇。
聲道：如果您沒有立體聲揚聲器，或您的音訊檔案為單聲道檔案，請選擇 [單聲道] (單聲道檔案的大小約為立體聲檔案的一半)。如果您要使用立體音響來聆聽 MP3 檔案，請選擇 [立體聲] 或 [自動]。[自動] 可以將已是單聲道的軌道轉換為單聲道 MP3 檔案，並將立體聲軌道轉換為立體聲 MP3 檔案。
立體聲模式：在 [一般] 模式下，您的 MP3 檔案在左、右立體聲聲道中各包含一個軌道。大多數情況下，這兩個聲道裡的資訊是相關的。[相接式立體聲] 模式可讓一個聲道播放兩個聲道上的相同內容，而讓另一個聲道播放其他的內容。160 kbps 或更低的位元傳輸率可以讓轉換後的音訊擁有更好的聲音品質。
智慧型編碼調整：若選擇此選項，iTunes 便可分析您的編碼設定和音樂來源，然後調整設定以大幅提升品質。
過濾低於 10 Hz 的頻率：過濾非音訊頻率可在毫不降低品質的前提下，製作出較小、效果較佳的檔案。